Download PostScript file
>A8AWJ3_LOOPS
1-15, 36-77, 85-170, 178-211, 222-244, 262-271, 277-292, 297-342, 350-402, 422-470, 487-573, 595-608, 614-636, 644-660, 667-1513, 1523-2141, 2146-2300, 2313-2395, 2403-2479, 2496-2507
MGKDLFNPHL RKFSIrklnv gvcsvllstl illgaATQVS ADETSASGVQ NEVARADLAE SPATATAPVA SEASQNAett vaatATEAPQ TAENTAPTNS ASESTEKPMD EQPVASETPQ PSVEKPVLPT EVKPAENTTP ASTEASPETV SPSRATDQPV ATRDSVQSSR srrlrrdLEA TAVTPGTGPA GADDATPIPR VSKPTLSESE Kkestqlakq iNWVDFSDTA SMKNLDPQGG FKVGtvfkke ispgyvvtlt vTELKPFNST EiykkrVEGT PTANTYDPNA INsylkGYKD YGKTPPSVTG RPQNKFSTIG GQGFDTQGRK TQIILPDDAV NWgikfkveA TYRGNPVKPS VVMADGEDAN PAEYGIFTTN GEGWEYVGEW MKGPRAKGPY TVmtedmvka fdktrkdgll iLKDKSVDWS KYLSPDTVTG GLGSQVFGPI ISASKAVPVV MTRGASEVGF yvatggqqal mmgflvVDSS DAPASYGEAY HTIGTRDSIA NTPINQPYLG STAADIDADS ESDWTADDRE DVADEGPAQL LTADQLSKTN DLLDLNKAKN GTYtlkikan pngnakayvk awvdFNNNGK FDDNEGSVvk eitANGDHTL SFNAIPGLTG GLVDQIgmrv riaTNAGDIE KPTGTAFSGE vedmlvRRVY PPQGEKQEST GFQGETQNAS VHFTAKGPDR SDFVTNASMS NQAPQVLDNQ GNVLTPTNGN TYVRPEGTYV VTANGDDVNV TFTPNEDFSG VAEGINIRRT DSNGSSTGWQ STDAADPNKN DRLNNMDGRF VPTVRKVPKY DSTGIQGQDQ SKELVFNDGD PAKTPVTPDA SRPATFVDAN GQPVTGNTVP AMSNGQQVGT YELDPNTGQV TFKPNKTFVG TPDPVAVQVS DTNGVPHRAR YQPTVTKVTP TGTGATSTGP QGVPQTGTPT FQGGDPLVPI DETVEPTFED GSKEKTIPGQ GTYTIAPDGT VTFTPDKQFV GNPDPVTVKR VDKNGTPVTA TYSPEFTKVT PTSTDATSNG IQGQPQKGTP TFTEGNPLVP IDDTKPMTFE DGQSTKTVPG VGEYSINPDG SITFTPDKKY VGTPNPVTVK RVDKNGTEVT ATYTPTVTKV TPTSTDATSN GIQGQPQKGT PTFTEGNPLV PIDDTKPMTF EDGQSTKTVP GVGEYNINPD GSITFTPDKQ YVGTPDPVTV KRVDKNGTEV TATYTPTVTK VTPTSTNATS TGPQGVPQTG TPTFQGGDPL VPIDETVEPT FEDGSKEKVI SGQGTYTIAP DGTVTFTPDK RFVGKPDPVT VKRVDKNGTL ATAIYSPEFT KVTPTGTGAT STGPQGLPQT GTPTFQGGDP LVPIDETVEP TFEDGSKEKT IPGQGTYTIA PDGTVTFTPD KQFVGKPDPV TVKRVDKNGT PVTATYSPEF TKVTPTGTGD KTEGLQGQVQ EGKVNFTPGH DSVPFPADST PLFDNGTAVK EVPNVGKFEV DADGKVTFTP DKQFKGETPE LELTRVDANG TPVtvkyqav vkEVTPTSTD ATSNGIQGQP QKGTPIFTEG NPLVPIDDTK PMTFEDGQST KTVPGVGEYS INPDGSITFT PDKQYVGTPD PVTVKRVDKN GTEVTATYTP TVTKVTPTST NATSTGPQGV PQTGTPTFQG GDPLVPIDET VEPTFDDGSK EKNIPGQGTY TIAPDGTVTF TPDKQFVGKP DPVTVKRVDK NGTEVTSIYT PTVTKVTPTG TGATSTGPQG LSQTGIPSFQ GGDPLVPIDE TVEPTFEDGS KEKSIPGQGT YTIAPDGTVT FTPDKQFVGK PDPVTVKRVD KNGTPVTATY SPEFTKVTPT GTGATSTGPQ GLPQTGTPTF QGGDPLVPID ETVEPTFEDG SKEKTIPGQG TYTIAPDGTV TFTPDKQFVG KPDPVTVKRV DKNGTPVTAT YSPEFTKVTP TGTGATSTGP QGLPQTGTPT FKGGDPLVPI DEAVEPTFED GSKEKSIPGQ GTYTIAPDGT VTFTPDKQFV GKPDPVTVKR VDKNGTPVTA TYRPEFTKVT PTGTGATSTG PQGLPQTGTP TFQGGDPLVP IDETVEPTFE DGSKEKTIPG QGTYTIVPDG TVTFTPDKQF VGKPDPVTVK RVDKNGTPVT ATYSPEFTKV TPIGKDASSE NikglVQTGT PTFEGGDPLV PIDETVAPTF EDGSTEKVIP GEGIYTISPD GTVTFTPEAD FVGKGTGVTI VRKDKNGTPV TASYRPTVVD PSTGQDTTST GAKGQTQVAT PAFEGHIDST VPPTFEDGST TLVVPGEGSY TIDKDGHITF TPEADFVGTA kgvvvkrldi ygNVVTAQYT PTVIGQTRVE DITSDGLKGQ TQTGKPIFEG DVDLTVAPTF EDGSTEKVVP GEGTYTISPD GVVTFIPEPN FVGTAkgvvv irKDRNGQTI SASYTPRVTE IPVVPNRPST PEQPKAPVIP VDPTVVVQTP KAEERVEPIY IDPKDEKGVL PRTGSQTSDq tasgllaaia sltffGLANR KKKSKED
>A8AWJ3_HOTLOOPS
1-10, 66-76, 85-129, 134-199, 204-221, 259-288, 350-357, 412-432, 549-583, 644-663, 678-688, 767-823, 901-934, 958-974, 985-1045, 1064-1076, 1082-1146, 1184-1237, 1259-1323, 1362-1379, 1387-1432, 1475-1513, 1525-1549, 1588-1641, 1664-1686, 1692-1741, 1766-1780, 1791-1842, 1867-1884, 1892-1943, 1969-1982, 1993-2044, 2069-2086, 2094-2140, 2170-2183, 2200-2242, 2256-2268, 2314-2352, 2360-2373, 2404-2471, 2493-2507
MGKDLFNPHL rkfsirklnv gvcsvllstl illgaatqvs adetsasgvq nevaradlae spataTAPVA SEASQNaett vaatATEAPQ TAENTAPTNS ASESTEKPMD EQPVASETPQ PSVEKPVLPt evkPAENTTP ASTEASPETV SPSRATDQPV ATRDSVQSSR SRRLRRDLEA TAVTPGTGPA GADDATPIPr vskPTLSESE KKESTQLAKQ Inwvdfsdta smknldpqgg fkvgtvfkke ispgyvvtLT VTELKPFNST EIYKKRVEGT PTANTYDPna insylkgykd ygktppsvtg rpqnkfstig gqgfdtqgrk tqiilpddav nwgikfkveA TYRGNPVkps vvmadgedan paeygifttn gegweyvgew mkgprakgpy tvmtedmvka fDKTRKDGLL ILKDKSVDWS KYlspdtvtg glgsqvfgpi isaskavpvv mtrgasevgf yvatggqqal mmgflvvdss dapasygeay htigtrdsia ntpinqpylg staadidads esdwtaddre dvadegpaQL LTADQLSKTN DLLDLNKAKN GTYTLKIKAN PNGnakayvk awvdfnnngk fddnegsvvk eitangdhtl sfnaipgltg glvdqigmrv riaTNAGDIE KPTGTAFSGE VEDmlvrrvy ppqgekqEST GFQGETQNas vhftakgpdr sdfvtnasms nqapqvldnq gnvltptngn tyvrpegtyv vtangddvnv tftpnedfsg vaeginIRRT DSNGSSTGWQ STDAADPNKN DRLNNMDGRF VPTVRKVPKY DSTGIQGQDQ SKElvfndgd paktpvtpda srpatfvdan gqpvtgntvp amsngqqvgt yeldpntgqv tfkpnktfvg tpdpvavqvs DTNGVPHRAR YQPTVTKVTP TGTGATSTGP QGVPqtgtpt fqggdplvpi detveptFED GSKEKTIPGQ GTYTiapdgt vtftPDKQFV GNPDPVTVKR VDKNGTPVTA TYSPEFTKVT PTSTDATSNG IQGQPQKGTP TFTEGnplvp iddtkpmtfe dgqSTKTVPG VGEYSInpdg sITFTPDKKY VGTPNPVTVK RVDKNGTEVT ATYTPTVTKV TPTSTDATSN GIQGQPQKGT PTFTEGnplv piddtkpmtf edgqstktvp gvgeyninpd gsiTFTPDKQ YVGTPDPVTV KRVDKNGTEV TATYTPTVTK VTPTSTNATS TGPQGVPqtg tptfqggdpl vpidetvePT FEDGSKEKVI SGQGTYTIAP DGTVTFTPDK RFVGKPDPVT VKRVDKNGTL ATAIYSPEFT KVTptgtgat stgpqglpqt gtptfqggdp lvpidetvep tFEDGSKEKT IPGQGTYTIa pdgtvtFTPD KQFVGKPDPV TVKRVDKNGT PVTATYSPEF TKVTPTGTGD KTeglqgqvq egkvnftpgh dsvpfpadst plfdngtavk evpnVGKFEV DADGKVTFTP DKQFKGETPE LELTRVDANG TPVtvkyqav vkevTPTSTD ATSNGIQGQP QKGTPIFTEg nplvpiddtk pmtfedgqst ktvpgvgeys inpdgsiTFT PDKQYVGTPD PVTVKRVDKN GTEVTATYTP TVTKVTPTST NATSTGPQGV Pqtgtptfqg gdplvpidet vepTFDDGSK EKNIPGQGTY TIAPDGtvtf tPDKQFVGKP DPVTVKRVDK NGTEVTSIYT PTVTKVTPTG TGATSTGPQG Lsqtgipsfq ggdplvpide tveptFEDGS KEKSIPGQGT ytiapdgtvt FTPDKQFVGK PDPVTVKRVD KNGTPVTATY SPEFTKVTPT GTGATSTGPQ GLpqtgtptf qggdplvpid etveptFEDG SKEKTIPGQG TYTIapdgtv tFTPDKQFVG KPDPVTVKRV DKNGTPVTAT YSPEFTKVTP TGTGATSTGP QGLpqtgtpt fkggdplvpi deaveptfED GSKEKSIPGQ GTytiapdgt vtFTPDKQFV GKPDPVTVKR VDKNGTPVTA TYRPEFTKVT PTGTGATSTG PQGLpqtgtp tfqggdplvp idetveptFE DGSKEKTIPG QGTYTIvpdg tvtFTPDKQF VGKPDPVTVK RVDKNGTPVT ATYSPEFTKV TPIGKDASSE nikglvqtgt ptfeggdplv pidetvaptF EDGSTEKVIP GEGiytispd gtvtftpeaD FVGKGTGVTI VRKDKNGTPV TASYRPTVVD PSTGQDTTST GAkgqtqvat pafegHIDST VPPTFEDGst tlvvpgegsy tidkdghitf tpeadfvgta kgvvvkrldi ygnVVTAQYT PTVIGQTRVE DITSDGLKGQ TQTGKPIFEG DVdltvaptF EDGSTEKVVP GEGtytispd gvvtfipepn fvgtakgvvv irkDRNGQTI SASYTPRVTE IPVVPNRPST PEQPKAPVIP VDPTVVVQTP KAEERVEPIY IDPKDEKGVL Prtgsqtsdq tasgllaaia slTFFGLANR KKKSKED
>A8AWJ3_REM465
39-48, 60-124, 132-174, 203-217, 673-684, 771-783, 1020-1036, 1222-1235, 1626-1639, 2230-2245, 2470-2480, 2499-2507
mgkdlfnphl rkfsirklnv gvcsvllstl illgaatqVS ADETSASGvq nevaradlaE SPATATAPVA SEASQNAETT VAATATEAPQ TAENTAPTNS ASESTEKPMD EQPVASETPQ PSVEkpvlpt eVKPAENTTP ASTEASPETV SPSRATDQPV ATRDSVQSSR SRRLrrdlea tavtpgtgpa gaddatpipr vsKPTLSESE KKESTQLakq inwvdfsdta smknldpqgg fkvgtvfkke ispgyvvtlt vtelkpfnst eiykkrvegt ptantydpna insylkgykd ygktppsvtg rpqnkfstig gqgfdtqgrk tqiilpddav nwgikfkvea tyrgnpvkps vvmadgedan paeygifttn gegweyvgew mkgprakgpy tvmtedmvka fdktrkdgll ilkdksvdws kylspdtvtg glgsqvfgpi isaskavpvv mtrgasevgf yvatggqqal mmgflvvdss dapasygeay htigtrdsia ntpinqpylg staadidads esdwtaddre dvadegpaql ltadqlsktn dlldlnkakn gtytlkikan pngnakayvk awvdfnnngk fddnegsvvk eitangdhtl sfnaipgltg glvdqigmrv riatnagdie kptgtafsge vedmlvrrvy ppQGEKQEST GFQGetqnas vhftakgpdr sdfvtnasms nqapqvldnq gnvltptngn tyvrpegtyv vtangddvnv tftpnedfsg vaeginirrt DSNGSSTGWQ STDaadpnkn drlnnmdgrf vptvrkvpky dstgiqgqdq skelvfndgd paktpvtpda srpatfvdan gqpvtgntvp amsngqqvgt yeldpntgqv tfkpnktfvg tpdpvavqvs dtngvphrar yqptvtkvtp tgtgatstgp qgvpqtgtpt fqggdplvpi detveptfed gskektipgq gtytiapdgt vtftpdkqfv gnpdpvtvkr vdkngtpvta tyspeftkvT PTSTDATSNG IQGQPQkgtp tftegnplvp iddtkpmtfe dgqstktvpg vgeysinpdg sitftpdkky vgtpnpvtvk rvdkngtevt atytptvtkv tptstdatsn giqgqpqkgt ptftegnplv piddtkpmtf edgqstktvp gvgeyninpd gsitftpdkq yvgtpdpvtv krvdkngtev tatytptvtk vTPTSTNATS TGPQGvpqtg tptfqggdpl vpidetvept fedgskekvi sgqgtytiap dgtvtftpdk rfvgkpdpvt vkrvdkngtl ataiyspeft kvtptgtgat stgpqglpqt gtptfqggdp lvpidetvep tfedgskekt ipgqgtytia pdgtvtftpd kqfvgkpdpv tvkrvdkngt pvtatyspef tkvtptgtgd kteglqgqvq egkvnftpgh dsvpfpadst plfdngtavk evpnvgkfev dadgkvtftp dkqfkgetpe leltrvdang tpvtvkyqav vkevtptstd atsngiqgqp qkgtpifteg nplvpiddtk pmtfedgqst ktvpgvgeys inpdgsitft pdkqyvgtpd pvtvkrvdkn gtevtatytp tvtkvTPTST NATSTGPQGv pqtgtptfqg gdplvpidet veptfddgsk eknipgqgty tiapdgtvtf tpdkqfvgkp dpvtvkrvdk ngtevtsiyt ptvtkvtptg tgatstgpqg lsqtgipsfq ggdplvpide tveptfedgs keksipgqgt ytiapdgtvt ftpdkqfvgk pdpvtvkrvd kngtpvtaty speftkvtpt gtgatstgpq glpqtgtptf qggdplvpid etveptfedg skektipgqg tytiapdgtv tftpdkqfvg kpdpvtvkrv dkngtpvtat yspeftkvtp tgtgatstgp qglpqtgtpt fkggdplvpi deaveptfed gskeksipgq gtytiapdgt vtftpdkqfv gkpdpvtvkr vdkngtpvta tyrpeftkvt ptgtgatstg pqglpqtgtp tfqggdplvp idetveptfe dgskektipg qgtytivpdg tvtftpdkqf vgkpdpvtvk rvdkngtpvt atyspeftkv tpigkdasse nikglvqtgt ptfeggdplv pidetvaptf edgstekvip gegiytispd gtvtftpead fvgkgtgvti vrkdkngtpv tasyrptvvD PSTGQDTTST GAKGQtqvat pafeghidst vpptfedgst tlvvpgegsy tidkdghitf tpeadfvgta kgvvvkrldi ygnvvtaqyt ptvigqtrve ditsdglkgq tqtgkpifeg dvdltvaptf edgstekvvp gegtytispd gvvtfipepn fvgtakgvvv irkdrngqti sasytprvte ipvvpnrpst peqpkapvip vdptvvvqtp kaeervepiy idpkdekgvL PRTGSQTSDQ tasgllaaia sltffglaNR KKKSKED
| JOB-ID | A8AWJ3_092527ZvZ6B38AAQEAAALCcroAAABO |
|---|---|
| Frames used | smooth=8 peak=8 join=4 |
| Thresholds used | coils=0.516 rem465=0.6 hot loops=0.1204 |
| Name | A8AWJ3 |
| Description | tr|A8AWJ3|A8AWJ3_STRGC Surface-associated protein CshA OS=Streptococcus gordonii (strain Challis / ATCC 35105 / BCRC 15272 / CH1 / DL1 / V288) OX=467705 GN=cshA PE=1 SV=1 |
| Title/ID | none |
| Sequence length | 2507 |
| Download predictions | smoothed scores raw scores |