Download PostScript file
>Q45996_LOOPS
36-49, 55-67, 74-118, 126-169, 178-240, 252-305, 335-359, 365-377, 389-409, 418-433, 440-452, 459-467, 482-506, 511-526, 537-556, 565-580, 587-599, 604-616, 629-671, 684-703, 712-727, 735-745, 751-763, 778-819, 830-850, 859-875, 881-892, 898-910, 925-966, 976-996, 1008-1022, 1028-1039, 1045-1057, 1071-1113, 1125-1144, 1153-1169, 1176-1187, 1193-1204, 1215-1241, 1271-1291, 1300-1362, 1377-1405, 1413-1423, 1431-1442, 1457-1478, 1487-1500, 1508-1546
mrkkslafll altmlvtllg aqltafaagt gvvsvQFNNG SSPASSNSIy arfkVTNTSG SPINLADlkl ryyYTQDADK PLTFWCDHAG YMSGSNYIDA TSKVTGSFKA VSPAVTNAdh ylevaLNSDA GSLPAGGSIE IQTRFARNDW SNFDQSNDWS YTAAGSYMDw qkisafvGGT LAYGSTPDGG NPPPQDPTIN PTSISAKAGS FADTKITLTP NGNTFNGISE LQSSQYTKGT nevtllasyl nTLPENTTKT LTFDFGVGTK NPKLTITVLP KDIPGDSLKV TVGTANGKPG DTVTVpvtfa dvakmknvgt cnfylgydas llevVSVDAG PIVKNAAVNF SSSASNGTIs flflDNTITD ELITADGvfa nikfklksVT AKTTTPVTFK DGGAFGDGTm skiasvtKTN GSVTIDPGTQ PTKelkvavG TANGKPGDTV TVpvtfadVV NVGNVGTcnf ylaydaslle vVSVDAGPIV KNAAVNFSSS ASNGTIsflf LDNTITDELI TSDGVFanik fklksvATKT TTPVTFKDGG AFGDGTmaki atvtKTNGSV TIDPGTQPTK elkvavGTAN GKPGDTVTVp vtfADVASAG NVGTCNfyla ydasllevVS VDAGPIVKNA AVNFSSSASN GSISFLFLDN TITDELITAD Gvfanikfkl ksvAAKTTTP VTFKDGGAFG DGTmtkiatv tKTNGSVTID PGTQPTKelk vavgTAEGNV GDTVTvpvtf ADVASAGNVG TCNfylayda slldvvsVAA GPIVKNAAVN FSSSASNGSI SFLFLDNTIT DELITADGVf anitfklksV TAKTTTPVTF KDGGAFGDGT makiatvtKT NGSVTIVPGI QPTKElkvav GTAEGNVGDT VTvpvtfADV ASAGNVGTCN fylaydasll dvvsVAAGPI VKNAAVNFSS SASNGSISFL FLDNTITDEL ITADGVfani sfklkSVTSK TTTPVTFKDG GAFGDGtmak iatviktNGS VTIVPGIQPT KElkvavGTA EGNVGDTVTv pvtfADVASA GNVGTCNfyl aydaslldvv SHAAGPIVKN RAVNFSSSAS NGSISFLFLD NTITDELITA DGVfanitfk lksvAAKTTT PVTFKDGGAF GDGTmakiat vtKTNGSVTI VPGIQPTKEl kvavgTASGK AGDTVTVpvt faDVATVGNV GTCNfyvtyd tnllEVASVT PGSIVTNAAV NFSSSTSNGT Isflfldnti tdqliktdgt faeikfklks VTAKTTTPVA FKDGGAFGDG TmakiatvtK TNGSVTIDVG DVTPVNPTIT PSTASFDKYV PANVNVTLTP NGNTFKGITG LTSGTDFTVS NNvvtisksy lstlavGSKT LTFDFGVTNN PVLTLTITDS TPVVTglgvk iaSVTGKTGD TITvpvtlsn VVKSGNVGTC NFyitydasm lqavsaTAGD IVLNAPVNFS SSINATTGti silfldNTIG DQLITSDGVV anltfkvVGT SSTTTPIAFK AGGAFGNGNM SKISDITFTN GSAKLN
>Q45996_HOTLOOPS
56-65, 275-286, 292-303, 348-356, 386-408, 418-432, 441-450, 495-503, 534-555, 565-579, 588-596, 643-650, 681-702, 710-726, 735-742, 790-797, 827-848, 859-873, 883-890, 937-944, 974-995, 1030-1037, 1122-1142, 1153-1167, 1177-1186, 1268-1289, 1299-1315, 1320-1330, 1344-1357, 1395-1404, 1413-1437, 1508-1546
mrkkslafll altmlvtllg aqltafaagt gvvsvqfnng sspassnsiy arfkvTNTSG SPINLadlkl ryyytqdadk pltfwcdhag ymsgsnyida tskvtgsfka vspavtnadh ylevalnsda gslpaggsie iqtrfarndw snfdqsndws ytaagsymdw qkisafvggt laygstpdgg npppqdptin ptsisakags fadtkitltp ngntfngise lqssqytkgt nevtllasyl ntlpenttkt ltfdfgvgtk npklTITVLP KDIPGDslkv tVGTANGKPG DTVtvpvtfa dvakmknvgt cnfylgydas llevvsvdag pivknaaVNF SSSASNgtis flfldntitd elitadgvfa nikfkLKSVT AKTTTPVTFK DGGAFGDGtm skiasvtKTN GSVTIDPGTQ PTkelkvavg TANGKPGDTV tvpvtfadvv nvgnvgtcnf ylaydaslle vvsvdagpiv knaaVNFSSS ASNgtisflf ldntitdeli tsdgvfanik fklKSVATKT TTPVTFKDGG AFGDGtmaki atvtKTNGSV TIDPGTQPTk elkvavgTAN GKPGDTvtvp vtfadvasag nvgtcnfyla ydasllevvs vdagpivkna avNFSSSASN gsisflfldn titdelitad gvfanikfkl KSVAAKTTTP VTFKDGGAFG DGtmtkiatV TKTNGSVTID PGTQPTkelk vavgTAEGNV GDtvtvpvtf advasagnvg tcnfylayda slldvvsvaa gpivknaavN FSSSASNgsi sflfldntit delitadgvf anitfkLKSV TAKTTTPVTF KDGGAFGDgt makiatvtKT NGSVTIVPGI QPTkelkvav gtAEGNVGDT vtvpvtfadv asagnvgtcn fylaydasll dvvsvaagpi vknaavNFSS SASNgsisfl fldntitdel itadgvfani sfkLKSVTSK TTTPVTFKDG GAFGDgtmak iatviktngs vtivpgiqpt kelkvavgtA EGNVGDTvtv pvtfadvasa gnvgtcnfyl aydaslldvv shaagpivkn ravnfsssas ngsisflfld ntitdelita dgvfanitfk lKSVAAKTTT PVTFKDGGAF GDgtmakiat vtKTNGSVTI VPGIQPTkel kvavgtASGK AGDTVTvpvt fadvatvgnv gtcnfyvtyd tnllevasvt pgsivtnaav nfssstsngt isflfldnti tdqliktdgt faeikfkLKS VTAKTTTPVA FKDGGAFGDg tmakiatvTK TNGSVTIDVG DVTPVnptiT PSTASFDKYV panvnvtltp ngnTFKGITG LTSGTDFtvs nnvvtisksy lstlavgskt ltfdfgvtnn pvltLTITDS TPVVtglgvk iaSVTGKTGD TITVPVTLSN VVKSGNVgtc nfyitydasm lqavsatagd ivlnapvnfs ssinattgti silfldntig dqlitsdgvv anltfkvVGT SSTTTPIAFK AGGAFGNGNM SKISDITFTN GSAKLN
>Q45996_REM465
1172-1180
mrkkslafll altmlvtllg aqltafaagt gvvsvqfnng sspassnsiy arfkvtntsg spinladlkl ryyytqdadk pltfwcdhag ymsgsnyida tskvtgsfka vspavtnadh ylevalnsda gslpaggsie iqtrfarndw snfdqsndws ytaagsymdw qkisafvggt laygstpdgg npppqdptin ptsisakags fadtkitltp ngntfngise lqssqytkgt nevtllasyl ntlpenttkt ltfdfgvgtk npkltitvlp kdipgdslkv tvgtangkpg dtvtvpvtfa dvakmknvgt cnfylgydas llevvsvdag pivknaavnf sssasngtis flfldntitd elitadgvfa nikfklksvt aktttpvtfk dggafgdgtm skiasvtktn gsvtidpgtq ptkelkvavg tangkpgdtv tvpvtfadvv nvgnvgtcnf ylaydaslle vvsvdagpiv knaavnfsss asngtisflf ldntitdeli tsdgvfanik fklksvatkt ttpvtfkdgg afgdgtmaki atvtktngsv tidpgtqptk elkvavgtan gkpgdtvtvp vtfadvasag nvgtcnfyla ydasllevvs vdagpivkna avnfsssasn gsisflfldn titdelitad gvfanikfkl ksvaaktttp vtfkdggafg dgtmtkiatv tktngsvtid pgtqptkelk vavgtaegnv gdtvtvpvtf advasagnvg tcnfylayda slldvvsvaa gpivknaavn fsssasngsi sflfldntit delitadgvf anitfklksv taktttpvtf kdggafgdgt makiatvtkt ngsvtivpgi qptkelkvav gtaegnvgdt vtvpvtfadv asagnvgtcn fylaydasll dvvsvaagpi vknaavnfss sasngsisfl fldntitdel itadgvfani sfklksvtsk tttpvtfkdg gafgdgtmak iatviktngs vtivpgiqpt kelkvavgta egnvgdtvtv pvtfadvasa gnvgtcnfyl aydaslldvv shaagpivkn ravnfsssas ngsisflfld ntitdelita dgvfanitfk lksvaakttt pvtfkdggaf gdgtmakiat vtktngsvti vpgiqptkel kVAVGTASGK agdtvtvpvt fadvatvgnv gtcnfyvtyd tnllevasvt pgsivtnaav nfssstsngt isflfldnti tdqliktdgt faeikfklks vtaktttpva fkdggafgdg tmakiatvtk tngsvtidvg dvtpvnptit pstasfdkyv panvnvtltp ngntfkgitg ltsgtdftvs nnvvtisksy lstlavgskt ltfdfgvtnn pvltltitds tpvvtglgvk iasvtgktgd titvpvtlsn vvksgnvgtc nfyitydasm lqavsatagd ivlnapvnfs ssinattgti silfldntig dqlitsdgvv anltfkvvgt sstttpiafk aggafgngnm skisditftn gsakln
| JOB-ID | Q45996_132009ZumCCX8AAQEAADCSMKoAAAAQ |
|---|---|
| Frames used | smooth=8 peak=8 join=4 |
| Thresholds used | coils=0.516 rem465=0.6 hot loops=0.1204 |
| Name | Q45996 |
| Description | tr|Q45996|Q45996_9FIRM Scaffolding protein OS=Ruminiclostridium cellulolyticum OX=1521 GN=cipC PE=1 SV=3 |
| Title/ID | none |
| Sequence length | 1546 |
| Download predictions | smoothed scores raw scores |