Download PostScript file
>Q46149_LOOPS
13-22, 58-70, 91-113, 160-174, 213-230, 236-243, 279-308, 325-335, 350-365, 378-397, 439-451, 461-488, 509-521, 547-561, 577-584, 593-615, 628-635, 655-674, 707-720, 728-744, 844-854, 879-887, 945-961, 1135-1159, 1188-1253, 1264-1284, 1301-1312, 1327-1355, 1363-1371, 1385-1416, 1455-1483, 1501-1529, 1617-1659, 1668-1708, 1718-1735, 1760-1811, 1822-1893, 1917-1928, 1937-2127, 2135-2178
mlitreqlmk iaSIPLKRKE PEynlildal enfnrdiegt svkeiyskls klnelvdNYQ TKYPSSGRNL alenfrdsly selrelikns RTSTIASKNL SFIWIGGPIS DQSleyynmw kmfnkdynir lfydknsllv ntlktaiiqe sskviieqnQ SNILDGTYGH NKFYsdrmkl iyrykrelkm lyenmkqnns vddiiinfls nyFKYDIGKL NNQKENNNNK miaigATDIN TENiltnklk syyyqeliqt nnlaaasdil riailkkyGG VYCDLDFLPG VNLSLFNDIS KPNGMDSNyw eaaifeaian ekklMNNYPY KYMEQvpsei kerilsfvrN HDINDLILPL GDIKIsqlei llsrlkaATG KKTFSNAFII SNNDSLTlnn lisqlenrye ilnsiiqekf kicetydsyi nsvselvlET TPKNLSMDGS Sfyqqiigyl SSGFKPEVNS TVFFSGPNIY SSATCDTYhf ikntfdmlss qnqeifeaSN NLYFSKTHDE Fksswllrsn iaekefqkli ktyigrTLNY EDGLNFNKWK Rvttsellkv ieevnsTKIY ENYDlnmilq iqGDDISYES AVNVFGKNPN KSILIqgvdd fanvfyfENG IVQSDninni lsrfndikki kltlIGHGEN VFNPKLFGGK TVNDlytnii kpklqhller egvilknkyl kinilgCYMF TPKVDINSTF vgklfnkISR DLQPKGFSKN QLEIsankya irinregkre vldyfgkwvs ntdliaeqis nkyvvywnev entlsarveq lnkvaefakd insiiqttnn qelkqslvnt yadlittlys ellKEDIPFE LDNIqikeri ilneisrlhd fsniildfYQ KNNISNNmii lfdsiikekd yynvklanki tgetsvikty sdslwnftnk ykkivddikg iivkDINGEF IKKADFEIEQ Npsllnsaml mqllidykpy teiltnmnts lkvqayaqif qlsigaiqea teivtiisda lnanfnilsk lkvgssvasv iidginliaa ltelknvktn ferklieakv gmysigfile ssslisgllg atavseilgv isvpvagilv glpslvnnil vlgekynqil dyfsKFYPIV GKNPFSIQDN IIIPYDDIAi telnfkynkf kygyakisgl kvglvthIGE NIDHYFSAPS LDHYIELSIY PALKLNDTNL PKGNVVLLPS GLNKVYKPEI SAIAGANSQE GNGvevlnli rnyYVDSNGN TKFPWKYEAP FEYSfsymrv eyfdtkvnvi LDNENKTLII PVltidemrn kisyeiLGDG GQYNVILPVN QTNINIVSNK NDIWNfdvsy ivKESKIEDN Kfvldgfinn ifstLKVSND GFKIGKQFIS IKNTPRAINL SFKINNnivi vsiylnheks nsitiissdl ndiknnfdnl ldniNYIGLG SISDNTINCI VRNDEVYMEG KIFlnekklv fiqnelelhl YDSVNKDSQY LINNPINNVV KYKDGYIVEg tflinstenk yslyiennki mlkglyless vfktiqdkiy skekvndyil slikkfftvn iqlcpfmivs gvdennryle ymlstnNKWI INGGYWENDF NNYKIVDFEK CNVIVSGSNK LNSEGDLADt idvldkdLEN LYIDSVIIIP KVYTKKIIIH PIPNNPQINI INTQSIHDkc hliidsvLTN NYHWESDGDD LIITNgldin irilqglsfg fkykniylkF SNYDELSLND FLLQNYNVKG LYYINGELHY KNIPGDTFEY GWINIDSRWY Ffdsinliak kGYQEIEGER YYFNPNTGVQ ESGVFLTPNG LEYFTNKHAS SKRWGRAINY TGWLTLDGNK YYFQSNSKAV TGLqkisdky yyfndngqmq ikwqiiNNNK YYFDGNTGea iigwfnNNKE RYYFDSEGRL LTGYQVIGDK SYYFSDNING NWEEGSGVLK SGIFKTPSGF KLFSSEGDKS AINYKGWLDL NGNKYYFNSD SIAVTGSYNI KGIQYYFNPK TAVLTNGWYT LDNNNYYVSN GHNVLGYQDI DGKGYYFDPS TGIQKAGVFP TPNGLRYFTM KPIDGQRWGQ CIDYTGWLHL NGNKYYFgyy nsavTGWRVL GGKRYFFNIK TGAATTGLLT LSGKRYYFNE KGEQLTLV
>Q46149_HOTLOOPS
11-22, 61-71, 91-104, 159-176, 383-396, 546-561, 730-754, 908-916, 1243-1252, 1299-1316, 1648-1657, 1855-1864, 2152-2178
mlitreqlmk IASIPLKRKE PEynlildal enfnrdiegt svkeiyskls klnelvdnyq TKYPSSGRNL Alenfrdsly selrelikns RTSTIASKNL SFIWiggpis dqsleyynmw kmfnkdynir lfydknsllv ntlktaiiqe sskviieqNQ SNILDGTYGH NKFYSDrmkl iyrykrelkm lyenmkqnns vddiiinfls nyfkydigkl nnqkennnnk miaigatdin teniltnklk syyyqeliqt nnlaaasdil riailkkygg vycdldflpg vnlslfndis kpngmdsnyw eaaifeaian ekklmnnypy kymeqvpsei kerilsfvrn hdindlilpl gdikisqlei llsrlkaatg kkTFSNAFII SNNDSLtlnn lisqlenrye ilnsiiqekf kicetydsyi nsvselvlet tpknlsmdgs sfyqqiigyl ssgfkpevns tvffsgpniy ssatcdtyhf ikntfdmlss qnqeifeasn nlyfskthde fksswllrsn iaekefqkli ktyigRTLNY EDGLNFNKWK Rvttsellkv ieevnstkiy enydlnmilq iqgddisyes avnvfgknpn ksiliqgvdd fanvfyfeng ivqsdninni lsrfndikki kltlighgen vfnpklfggk tvndlytnii kpklqhller egvilknkyl kinilgcymf tpkvdinstf vgklfnkisR DLQPKGFSKN QLEISANKYA IRINregkre vldyfgkwvs ntdliaeqis nkyvvywnev entlsarveq lnkvaefakd insiiqttnn qelkqslvnt yadlittlys ellkedipfe ldniqikeri ilneisrlhd fsniildfyq knnisnnmii lfdsiikekd yynvklaNKI TGETSVikty sdslwnftnk ykkivddikg iivkdingef ikkadfeieq npsllnsaml mqllidykpy teiltnmnts lkvqayaqif qlsigaiqea teivtiisda lnanfnilsk lkvgssvasv iidginliaa ltelknvktn ferklieakv gmysigfile ssslisgllg atavseilgv isvpvagilv glpslvnnil vlgekynqil dyfskfypiv gknpfsiqdn iiipyddiai telnfkynkf kygyakisgl kvglvthige nidhyfsaps ldhyielsiy palklndtnl pkgnvvllps glnkvykpei saIAGANSQE GNgvevlnli rnyyvdsngn tkfpwkyeap feysfsymrv eyfdtkvnVI LDNENKTLII PVLTIDemrn kisyeilgdg gqynvilpvn qtninivsnk ndiwnfdvsy ivkeskiedn kfvldgfinn ifstlkvsnd gfkigkqfis ikntprainl sfkinnnivi vsiylnheks nsitiissdl ndiknnfdnl ldninyiglg sisdntinci vrndevymeg kiflnekklv fiqnelelhl ydsvnkdsqy linnpinnvv kykdgyiveg tflinstenk yslyiennki mlkglyless vfktiqdkiy skekvndyil slikkfftvn iqlcpfmivs gvdennryle ymlstnnkwi inggywendf nnykivdfek cnvivsgSNK LNSEGDLadt idvldkdlen lyidsviiip kvytkkiiih pipnnpqini intqsihdkc hliidsvltn nyhwesdgdd liitngldin irilqglsfg fkykniylkf snydelslnd fllqnynvkg lyyingelhy knipgdtfey gwinidsrwy ffdsinliak kgyqeieger yyfnpntgvq esgvfltpng leyfTNKHAS SKRWgrainy tgwltldgnk yyfqsnskav tglqkisdky yyfndngqmq ikwqiinnnk yyfdgntgea iigwfnnnke ryyfdsegrl ltgyqvigdk syyfsdning nweegsgvlk sgifktpsgf klfssegdks ainykgwldl ngnkyyfnsd siavtgsyni kgiqyyfnpk tavltngwyt ldnnnyyvsn ghnvlgyqdi dgkgyyfdps tgiqkagvfp tpnglryftm kpidgqrwgq cidytgwlhl ngnkyyfgyy nsavtgwrvl ggkryffnik tGAATTGLLT LSGKRYYFNE KGEQLTLV
>Q46149_REM465
none
mlitreqlmk iasiplkrke peynlildal enfnrdiegt svkeiyskls klnelvdnyq tkypssgrnl alenfrdsly selrelikns rtstiasknl sfiwiggpis dqsleyynmw kmfnkdynir lfydknsllv ntlktaiiqe sskviieqnq snildgtygh nkfysdrmkl iyrykrelkm lyenmkqnns vddiiinfls nyfkydigkl nnqkennnnk miaigatdin teniltnklk syyyqeliqt nnlaaasdil riailkkygg vycdldflpg vnlslfndis kpngmdsnyw eaaifeaian ekklmnnypy kymeqvpsei kerilsfvrn hdindlilpl gdikisqlei llsrlkaatg kktfsnafii snndsltlnn lisqlenrye ilnsiiqekf kicetydsyi nsvselvlet tpknlsmdgs sfyqqiigyl ssgfkpevns tvffsgpniy ssatcdtyhf ikntfdmlss qnqeifeasn nlyfskthde fksswllrsn iaekefqkli ktyigrtlny edglnfnkwk rvttsellkv ieevnstkiy enydlnmilq iqgddisyes avnvfgknpn ksiliqgvdd fanvfyfeng ivqsdninni lsrfndikki kltlighgen vfnpklfggk tvndlytnii kpklqhller egvilknkyl kinilgcymf tpkvdinstf vgklfnkisr dlqpkgfskn qleisankya irinregkre vldyfgkwvs ntdliaeqis nkyvvywnev entlsarveq lnkvaefakd insiiqttnn qelkqslvnt yadlittlys ellkedipfe ldniqikeri ilneisrlhd fsniildfyq knnisnnmii lfdsiikekd yynvklanki tgetsvikty sdslwnftnk ykkivddikg iivkdingef ikkadfeieq npsllnsaml mqllidykpy teiltnmnts lkvqayaqif qlsigaiqea teivtiisda lnanfnilsk lkvgssvasv iidginliaa ltelknvktn ferklieakv gmysigfile ssslisgllg atavseilgv isvpvagilv glpslvnnil vlgekynqil dyfskfypiv gknpfsiqdn iiipyddiai telnfkynkf kygyakisgl kvglvthige nidhyfsaps ldhyielsiy palklndtnl pkgnvvllps glnkvykpei saiagansqe gngvevlnli rnyyvdsngn tkfpwkyeap feysfsymrv eyfdtkvnvi ldnenktlii pvltidemrn kisyeilgdg gqynvilpvn qtninivsnk ndiwnfdvsy ivkeskiedn kfvldgfinn ifstlkvsnd gfkigkqfis ikntprainl sfkinnnivi vsiylnheks nsitiissdl ndiknnfdnl ldninyiglg sisdntinci vrndevymeg kiflnekklv fiqnelelhl ydsvnkdsqy linnpinnvv kykdgyiveg tflinstenk yslyiennki mlkglyless vfktiqdkiy skekvndyil slikkfftvn iqlcpfmivs gvdennryle ymlstnnkwi inggywendf nnykivdfek cnvivsgsnk lnsegdladt idvldkdlen lyidsviiip kvytkkiiih pipnnpqini intqsihdkc hliidsvltn nyhwesdgdd liitngldin irilqglsfg fkykniylkf snydelslnd fllqnynvkg lyyingelhy knipgdtfey gwinidsrwy ffdsinliak kgyqeieger yyfnpntgvq esgvfltpng leyftnkhas skrwgrainy tgwltldgnk yyfqsnskav tglqkisdky yyfndngqmq ikwqiinnnk yyfdgntgea iigwfnnnke ryyfdsegrl ltgyqvigdk syyfsdning nweegsgvlk sgifktpsgf klfssegdks ainykgwldl ngnkyyfnsd siavtgsyni kgiqyyfnpk tavltngwyt ldnnnyyvsn ghnvlgyqdi dgkgyyfdps tgiqkagvfp tpnglryftm kpidgqrwgq cidytgwlhl ngnkyyfgyy nsavtgwrvl ggkryffnik tgaattgllt lsgkryyfne kgeqltlv
| JOB-ID | Q46149_032504Zws9kH8AAQEAAGAGYpMAAAAX |
|---|---|
| Frames used | smooth=8 peak=8 join=4 |
| Thresholds used | coils=0.516 rem465=0.6 hot loops=0.1204 |
| Name | Q46149 |
| Description | sp|Q46149|TCDA_CLONO Toxin A OS=Clostridium novyi OX=1542 GN=tcdA PE=1 SV=1 |
| Title/ID | none |
| Sequence length | 2178 |
| Download predictions | smoothed scores raw scores |