Download PostScript file
>Q53654_LOOPS
19-186, 195-274, 299-328, 336-364, 375-420, 441-449, 456-468, 473-494, 505-556, 564-596, 603-645, 664-684, 701-743, 751-783, 790-832, 851-871, 888-930, 938-970, 977-1019, 1038-1059, 1073-1154
mnknvlkfmv fimllniiTP LFNKNEAFAA RDISSTNVTD LTVSPSKIED GGKTTVKMTF DDKNGKIQNG DMIKVAWPTS GTVKIEGYSK TVPLTVKGEQ VGQAVITPDG ATITFNDKVE KLSDVSGFAE FEVQGRNLTQ TNTSDDKVAT ITSGNKSTNV TVHKSEAGTS SVFYYKTGDM LPEDTThvrw flniNNEKSY VSKDITIKDQ IQGGQQLDLS TLNINVTGTH SNYYSGQSAI TDFEKAFPGS KITVDNTKNT IDVTIPQGYG SYNSfsinyk tkitneqqke fvnnsqawYQ EHGKEEVNGK SFNHTVHNIN ANAGIEGTvk gelkvLKQDK DTKAPIANVK FKLSKKDGSV VKDNqkeiei itdaNGIANI KALPSGDYIL KEIEAPRPYT FDKDKEYPFT MKDTDNQGYF ttienakaie ktkdvsaqkv WEGTQKVKPt iyfklYKQDD NQNTTPVDka eiKKLEDGTT KVTWSNLPEN DKNGkaikyl vkevNAQGED TTPEGYTKKE NGLVVTNTEK PIETTSISGE KVWDDKDNQD GKRPEKvsvn llaNGEKVKT LDVTSETNWK YEFKDLPKYD EGKKIEytvt edHVKDYTTD INGTTITNKY TPGETSATVT KNWDDNNNQD GKRPTeikve lyqdgkatgk taiLNESNNW THTWTGLDEK AKGQqvkytv eeltkvkgyt THVDNNDMGN LIVTNKYTPE TTSISGEKVW DDKDNQDGKR PEKvsvnlla DGEKVKTLDV TSETNWKYEF KDLPKYDEGK KIEytvtedH VKDYTTDING TTITNKYTPG ETSATVTKNW DDNNNQDGKR PTeikvelyq dgkatgktai LNESNNWTHT WTGLDEKAKG Qqvkytveel tkvkgytTHV DNNDMGNLIV TNKYTPETTS ISGEKVWDDK DNQDGKRPEK vsvnllaNGE KVKTLDVTSE TNWKYEFKDL PKYDEGKKIE ytvtedHVKD YTTDINGTTI TNKYTPGETS ATVTKNWDDN NNQDGKRPTe ikvelyqdgk atgktaiLNE SNNWTHTWTG LDEKAKGQQv kytvdeltkv ngYTTHVDNN DMGNLIVTNK YTPKKPNKPI YPEKPKDKTP PTKPDHSNKV KPTPPDKPSK VDKDDQPKDN KTKPENPLKE LPKTgmkiit switwvfigi lglylilrkr fns
>Q53654_HOTLOOPS
32-82, 132-170, 251-272, 320-328, 337-364, 369-382, 429-495, 505-592, 599-645, 676-685, 699-711, 717-779, 786-832, 863-872, 886-898, 904-966, 973-1019, 1073-1155
mnknvlkfmv fimllniitp lfnkneafaa rDISSTNVTD LTVSPSKIED GGKTTVKMTF DDKNGKIQNG DMIKVAWPTS GTvkiegysk tvpltvkgeq vgqavitpdg atitfndkve klsdvsgfae fEVQGRNLTQ TNTSDDKVAT ITSGNKSTNV TVHKSEAGTS svfyyktgdm lpedtthvrw flninneksy vskditikdq iqggqqldls tlninvtgth snyysgqsai tdfekafpgs KITVDNTKNT IDVTIPQGYG SYnsfsinyk tkitneqqke fvnnsqawyq ehgkeevngk sfnhtvhniN ANAGIEGTvk gelkvlKQDK DTKAPIANVK FKLSKKDGSV VKDNqkeiEI ITDANGIANI KAlpsgdyil keieaprpyt fdkdkeypft mkdtdnqgyf ttienakaIE KTKDVSAQKV WEGTQKVKPT IYFKLYKQDD NQNTTPVDKA EIKKLEDGTT KVTWSNLPEN DKNGKaikyl vkevNAQGED TTPEGYTKKE NGLVVTNTEK PIETTSISGE KVWDDKDNQD GKRPEKVSVN LLANGEKVKT LDVTSETNWK YEFKDLPKYD EGkkieytVT EDHVKDYTTD INGTTITNKY TPGETSATVT KNWDDNNNQD GKRPTeikve lyqdgkatgk tailnesnnw thtwtGLDEK AKGQQvkytv eeltkvkgYT THVDNNDMGN LivtnkYTPE TTSISGEKVW DDKDNQDGKR PEKVSVNLLA DGEKVKTLDV TSETNWKYEF KDLPKYDEGk kieytVTEDH VKDYTTDING TTITNKYTPG ETSATVTKNW DDNNNQDGKR PTeikvelyq dgkatgktai lnesnnwtht wtGLDEKAKG QQvkytveel tkvkgYTTHV DNNDMGNLiv tnkYTPETTS ISGEKVWDDK DNQDGKRPEK VSVNLLANGE KVKTLDVTSE TNWKYEFKDL PKYDEGkkie ytVTEDHVKD YTTDINGTTI TNKYTPGETS ATVTKNWDDN NNQDGKRPTe ikvelyqdgk atgktailne snnwthtwtg ldekakgqqv kytvdeltkv ngYTTHVDNN DMGNLIVTNK YTPKKPNKPI YPEKPKDKTP PTKPDHSNKV KPTPPDKPSK VDKDDQPKDN KTKPENPLKE LPKTGmkiit switwvfigi lglylilrkr fns
>Q53654_REM465
1105-1142
mnknvlkfmv fimllniitp lfnkneafaa rdisstnvtd ltvspskied ggkttvkmtf ddkngkiqng dmikvawpts gtvkiegysk tvpltvkgeq vgqavitpdg atitfndkve klsdvsgfae fevqgrnltq tntsddkvat itsgnkstnv tvhkseagts svfyyktgdm lpedtthvrw flninneksy vskditikdq iqggqqldls tlninvtgth snyysgqsai tdfekafpgs kitvdntknt idvtipqgyg synsfsinyk tkitneqqke fvnnsqawyq ehgkeevngk sfnhtvhnin anagiegtvk gelkvlkqdk dtkapianvk fklskkdgsv vkdnqkeiei itdangiani kalpsgdyil keieaprpyt fdkdkeypft mkdtdnqgyf ttienakaie ktkdvsaqkv wegtqkvkpt iyfklykqdd nqnttpvdka eikkledgtt kvtwsnlpen dkngkaikyl vkevnaqged ttpegytkke nglvvtntek piettsisge kvwddkdnqd gkrpekvsvn llangekvkt ldvtsetnwk yefkdlpkyd egkkieytvt edhvkdyttd ingttitnky tpgetsatvt knwddnnnqd gkrpteikve lyqdgkatgk tailnesnnw thtwtgldek akgqqvkytv eeltkvkgyt thvdnndmgn livtnkytpe ttsisgekvw ddkdnqdgkr pekvsvnlla dgekvktldv tsetnwkyef kdlpkydegk kieytvtedh vkdyttding ttitnkytpg etsatvtknw ddnnnqdgkr pteikvelyq dgkatgktai lnesnnwtht wtgldekakg qqvkytveel tkvkgytthv dnndmgnliv tnkytpetts isgekvwddk dnqdgkrpek vsvnllange kvktldvtse tnwkyefkdl pkydegkkie ytvtedhvkd yttdingtti tnkytpgets atvtknwddn nnqdgkrpte ikvelyqdgk atgktailne snnwthtwtg ldekakgqqv kytvdeltkv ngytthvdnn dmgnlivtnk ytpkkpnkpi ypekPKDKTP PTKPDHSNKV KPTPPDKPSK VDKDDQPKDN KTkpenplke lpktgmkiit switwvfigi lglylilrkr fns
| JOB-ID | Q53654_213516Zun2FH8AAQEAADCTwHsAAABV |
|---|---|
| Frames used | smooth=8 peak=8 join=4 |
| Thresholds used | coils=0.516 rem465=0.6 hot loops=0.1204 |
| Name | Q53654 |
| Description | sp|Q53654|CNA_STAAU Collagen adhesin OS=Staphylococcus aureus OX=1280 GN=cna PE=1 SV=1 |
| Title/ID | none |
| Sequence length | 1183 |
| Download predictions | smoothed scores raw scores |